MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16I

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021528	TAAT	2	8	1725	1732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021528	TCA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021528	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021528	GTTGA	2	10	1801	1810	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021528	T	7	7	1915	1921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021528	ACG	2	6	2045	2050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021528	GTA	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021528	TTG	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021528	GTTAT	2	10	2168	2177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021528	GTA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021528	TTG	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021528	A	7	7	2402	2408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021528	TTAT	2	8	2664	2671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021528	GATA	2	8	2675	2682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021528	ACA	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021528	CAA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021528	A	6	6	2821	2826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021528	TGT	2	6	2831	2836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021528	TTA	2	6	2837	2842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021528	CAA	2	6	2850	2855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021528	AAC	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021528	TAT	2	6	2926	2931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021528	TA	3	6	2958	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021528	TAA	2	6	2974	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021528	GTATT	2	10	3001	3010	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021528	GAA	2	6	3045	3050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021528	GT	3	6	3070	3075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021528	AGTA	2	8	3087	3094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021528	TAC	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021528	TTA	2	6	3148	3153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021528	GTA	2	6	3177	3182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021528	A	6	6	3281	3286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021528	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021528	CAGT	2	8	3393	3400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021528	ACA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021528	AAC	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021528	T	6	6	4688	4693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021528	CG	3	6	4739	4744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021528	TA	3	6	4795	4800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021528	TAACC	2	10	4816	4825	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_021528	TAG	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021528	A	6	6	5008	5013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021528	ATTT	2	8	5045	5052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021528	C	6	6	5058	5063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_021528	TTCA	2	8	5098	5105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021528	GTGC	2	8	5119	5126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021528	ATAAA	2	10	5145	5154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021528	A	6	6	5179	5184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021528	A	7	7	5204	5210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021528	AGCT	2	8	5242	5249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021528	TAAA	2	8	5293	5300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021528	ATT	2	6	5397	5402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021528	TGG	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021528	TCA	2	6	6183	6188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021528	ACT	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021528	GTA	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021528	CAC	2	6	6334	6339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021528	AAC	2	6	6392	6397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021528	AACT	2	8	6478	6485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021528	GAA	3	9	6558	6566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021528	TGT	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021528	CTAA	2	8	6642	6649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021528	A	7	7	6660	6666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021528	ATTT	2	8	6692	6699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021528	GTT	2	6	6703	6708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021528	CCGC	2	8	6756	6763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_021528	CGTG	2	8	6766	6773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021528	GCC	2	6	6776	6781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021528	GCG	2	6	6835	6840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021528	CTAC	2	8	6984	6991	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021528	TAG	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021528	T	7	7	7074	7080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021528	ACT	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021528	CATTT	2	10	7676	7685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021528	A	7	7	7699	7705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021528	ATG	2	6	7841	7846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021528	ATC	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021528	CTT	2	6	7905	7910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021528	GGC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021528	GCT	2	6	7966	7971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021528	TAA	2	6	8054	8059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021528	AT	3	6	8114	8119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021528	A	6	6	8125	8130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021528	TAG	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021528	AT	3	6	8202	8207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021528	AAC	2	6	8218	8223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021528	ATGT	2	8	8270	8277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021528	AAT	2	6	8349	8354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021528	A	6	6	8376	8381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021528	AAG	2	6	8385	8390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021528	ATT	2	6	8393	8398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021528	TTTTTG	2	12	8446	8457	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021528	TA	3	6	8464	8469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021528	AT	3	6	8471	8476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021528	AACT	2	8	8560	8567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021528	GTGA	2	8	8694	8701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021528	GAAT	2	8	8753	8760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021528	T	7	7	8860	8866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021528	T	6	6	8922	8927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021528	A	6	6	9101	9106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021528	TTTTA	2	10	9111	9120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021528	ATC	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021528	TTGA	2	8	10127	10134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021528	AGTA	2	8	10174	10181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021528	TA	4	8	10180	10187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021528	ATAA	2	8	10857	10864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021528	TTA	2	6	10886	10891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021528	TAAAA	2	10	10904	10913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021528	CTT	2	6	10915	10920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021528	AT	3	6	10962	10967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021528	A	6	6	10999	11004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021528	ATG	2	6	11021	11026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021528	T	7	7	11053	11059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021528	TGG	2	6	11107	11112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021528	TAAA	2	8	11188	11195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021528	TA	3	6	11231	11236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021528	ATA	2	6	11247	11252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021528	A	6	6	11259	11264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021528	TGC	3	9	11290	11298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021528	ACA	2	6	11310	11315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021528	A	6	6	12332	12337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021528	CGAA	2	8	12415	12422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021528	CAA	2	6	12495	12500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021528	A	6	6	12615	12620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021528	CTA	2	6	12681	12686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021528	AATC	2	8	12794	12801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021528	ATG	2	6	12830	12835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021528	TTA	2	6	12911	12916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021528	ATCG	2	8	12923	12930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021528	GAC	2	6	12970	12975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021528	ACTA	2	8	12994	13001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021528	GTA	2	6	13140	13145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021528	ACG	3	9	13223	13231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.